隨著科技的進步，經濟的發展，我國的現代化建設日新月異，人民生活質量不斷提高。國家在制藥企業實施了GMP認證制度。在醫療機構，潔凈手術部、ICU監護室、血液病無菌病房及負壓病房等潔凈室大量興建，使醫院的就診環境、醫療水平及服務質量得到提高。這對醫藥企業的凈化空調系統管理提出了較高的要求，擺在管理部門面前的任務就是努力配合醫藥一線的工作，探索一套切實可行的管理方法，進行科學的運行管理，滿足醫療及生產的要求。為使凈化空調系統管理更具專業性、技術性，使系統運行更有條理、管理工作更有規律，有必要設置專門的管理部門來滿足這方面的要求。對于未設置自控裝置的潔凈室，管理人員的專業化就顯得更為重要，所以，管理部門應由專業的工程技術人員組成，對與潔凈室的使用有關的水、暖、電、氣、凈化空調消防等設施進行有效的管理。
為科學和有序地對凈化空調系統進行管理，必須制訂一套合理的管理制度，以形成正常的工作秩序。這些制度應包括:
1）崗位責任制。規定班組長、值班人員、維修和運行人員的工作內容及職責。
2）運行管理守則。包括值班守則、維修守則、驗證程序和調試守則。
3）儀表、設備安裝運行操作制度。規定各種儀表設備的安裝、使用操作程序和注意事項。
4）儀表工具保管制度等。
凈化空調系統運行直接關系到潔凈室的溫度、濕度、潔凈度及壓差等參數能否滿足要求。運行質量的好壞，很大程度上取決于值班人員能否按規定要求進行操作。凈化空調系統每班值班人員宜安排兩人，值班人員應做到:
1）根據室外氣象條件結合潔凈室的要求確定本班運行方案。開車前要對設備進行檢查，做好運行準備。檢查項目包括:風機水泵等轉動設備有無異常；定壓水箱及冷卻塔水池水位是否合適；閥門開啟位置是否正確；電源電壓是否穩定等。如發現問題應及時向班組長報告。如無異常，準備就緒后便可開機開機時必須按順序操作，如果沒有自動控制系統，開機順序:先開送風機，后開回風機和排風機，再開電加熱器和水泵（冷水泵及冷卻水泵），最后開冷水機組。開啟冷卻塔時應觀察冷水機組的冷凝壓力，若太低，不可開啟。當冷水機組的冷凝壓力達到規定數值時方可開啟冷卻塔。關機順序與開機相反，即先關閉冷水機組，再依次關閉電加熱器、水泵（冷水泵及冷卻水泵）、回風機和排風機、送風機。關機后要全面檢查，消除不安全因素，拉下電閘（冷水機組預熱電源不可斷開），關閉相關閥門、照明開關及門窗等。如果凈化空調系統設有自控裝置，則開、關機組只要按要求按壓啟、停按鈕即可。
2）值班人員要認真負責，勤巡視、勤檢查做好運行參數記錄，并根據氣象變化適時調整運行方案。隨時觀察各種儀表的數據、設備的運行情況；注意運轉設備的聲音、軸承溫度、水泵冷卻風扇的運行情況等；要與潔凈室內管理人員經常聯系，必要時進入潔凈室巡視檢查。做到及時發現問題及時解決。結合運行中遇到的實際問題，不斷總結運行經驗，摸索運行規律，值班人員不準擅離職守。
3）運行參數一般每小時記錄一次。記錄數據時，錯寫后只能重寫，不許涂改。
4）注意安全。女工值班時應戴工作帽，長發應盤入工作帽內無關人員不許進入機房和值班室。電氣線路維修時，一定要掛警告牌嚴禁隨便合閘，合閘時要嚴密注意周圍人員有無觸電危險。出了事故，首先防止事故蔓延，并保持現場，冷靜處理，不要慌張。
5）值班人員負責整個凈化空調系統的管理當進行設備維修或來人參觀時，必須征得值班員的同意和配合，并做好記錄，確保系統正常運行。
6）值班人員應同維修人員配合，一起進行日常維護工作，并經常向班組長及維修人員匯報儀表、設備運轉情況。
7）必須經常保持值班室和機房的整潔。值班室和機房衛生應每天清潔，組合式空調機組內部應每季度認真清掃洗刷一次，對表冷器的凝水盤應適時進行消毒滅菌，保證不對潔凈室產生污染。
8）對維修工具的保管，值班人員要嚴格執行借用手續，并經常清查清點，特別是在設備維修后，及時清查以防工具落入設備內，造成事故。
9）如果遇到事故需緊急停機時，應及時通知車間，把影響降到最低，并立即通知相關部門。
10）要嚴格遵守交接班制度，當班人員需向接班人員詳細介紹運行情況、應注意的問題和需要繼續進行的工作等。嚴禁當班人員在接班人員未到達之前離開值班崗位。